Puffles Unicórnios são uma espécie mística de Puffles. Podem ser identificados por sua crina e seu chifre saindo de sua cabeça. Os pinguins poderiam se transformar neles durante a Festa Medieval 2013 se fizessem corretamente a Poção do Puffle Unicórnio. Existem puffles unicórnios brancos e pretos. Diferentemente dos Puffles Pretos, os puffles unicórnios pretos são sempre vistos sorrindo. Também existe o Amarelo, que podia ser adotado por assinantes através do aplicativo Floresta Puffle. Os amarelos se diferenciam dos brancos e pretos por sua crina reta ao chifre e seu focinho.