Um jogador derrota outro ao vencer com três cartas de elementos e cores diferentes.
Para jogar, primeiro é preciso ir até o Sensei e falar com ele, ele dará ao jogador seu Primeiro Deque com nove cartas básicas dos três elementos e uma ou duas Cartas Especiais de elementos aleatórios. Depois, é possível ir até o Sensei para conquistar as faixas, ou subir nos tatames e jogar com outros pinguins.
O jogo funciona de uma maneira semelhante ao pedra-papel-tesoura: cada rodada, os dois jogadores selecionam uma carta do seu deque disponível. Cartas do tipo fogo vencem o tipo neve, o tipo neve vence o tipo água, e o tipo água vence o tipo fogo. Se as duas cartas forem do mesmo elemento, a carta com o maior número vence. Se forem do mesmo elemento e mesmo número, nenhum dos dois jogadores vence. Depois que uma carta é usada, ela é substituída por uma outra carta do deque do jogador.
Para ganhar a partida, é preciso ter vencido três rodadas com cartas do mesmo elemento e cores diferentes ou de elementos diferentes e cores diferentes. Conforme o jogador vence mais partidas, ele avança no seu progresso para obter mais faixas. Depois de obter a Faixa Preta é possível vencer o Sensei e se tornar um Ninja (o jogo não permite que o jogador vença o Sensei antes de ter a Faixa Preta).
Faixas
À medida que você vai ganhando ou até mesmo perdendo no jogo, você vai progredindo no Progresso Ninja, que pode ser visto clicando no ícone do Desafio Ninja presente nos Dojos. Quando você avança, você vai ganhando faixas de acordo com a seguinte ordem:
Cartas
Uma das animações produzidas por uma Carta Especial.
É possível aumentar seu deque de cartas usando códigos de deques de Desafio Ninja vendidos na vida real. Para os assinantes, também é possível comprar Cartas Especiais do catálogo Obras de Artes Marciais, onde um kit de 3 cartas é vendido por 1500 moedas.
Cada carta possui um elemento (Fogo, Água ou Neve), um número (mínimo 2 e máximo 12) e uma cor (azul, verde, laranja, lilás, vermelho, amarelo ou azul). As Cartas Especiais são geralmente mais fortes, possuem um valor de pelo menos 9 e podem ser identificadas pelo seu "brilho". Quando usadas, elas produzem uma animação, diferente para cada carta e baseada no seu desenho. Algumas Cartas Especiais também podem adicionar um modificador na rodada seguinte e dar uma vantagem ao jogador que a ativou.
Lista de modificadores
O deque de cartas visto dentro do jogo. A Carta Especial pode ser identificada pelo seu brilho.
Imagem
Efeito
O oponente não poderá usar cartas de um elemento.
Cartas de menor valor vencerão cartas de maior valor.
O valor da próxima carta do oponente será diminuído em 2.
O valor da próxima carta do usuário será aumentado em 2.
Uma das vitórias do oponente com um certo tipo é destruída.
Uma das vitórias do oponente com uma certa cor é destruída.
Você poderá jogar com 2 a 4 jogadores. Vocês jogam em um vulcão, em cima de pedras formando um círculo grande. Nesse círculo, as pedras tem os desenhos de Desafio Ninja, Água, Neve e Fogo. Dentro desse círculo, aparece outro círculo, mas nele só tem pedras vazias. Na sua vez de jogar, você clica em uma das pedras, e aparecerá um número de 1 a 6. Você poderá ir para a esquerda ou para a direita, seguindo esses números. Se cair na casa Fogo, os jogadores terão de jogar uma carta fogo, e a carta de maior número vence. Isso acontece com Neve e Água também. Se cair na casa Desafio Ninja, você deverá escolher outro jogador para duelar com você no Desafio Ninja clássico. Se cair junto com outro jogador em uma casa, vocês duelaram no Desafio Ninja normal. Se você perder no Desafio Ninja normal dentro do vulcão e você perder, você perderá energia de 6 para 5, pois você estará dando uma a quem ganhou de você. Os três que mandarem a menor carta perderão uma energia, mas o vencedor não ganhará nem perderá nada. Quem chegar a 0 energias, sairá do jogo. Quando estiver jogando o Desafio Fogo, se você não tiver a carta do elemento, você terá de escolher uma de outro elemento para jogar, mas isso fará com que você perca a energia de qualquer jeito, por isso aconselho a jogar a carta com menor número que tiver. Seu Quimono Fogo é composto por quatro partes: sapato, roupa, máscara e capacete. Quando conseguir o capacete, desafie o Sensei do Fogo para ganhar a Pedra do Fogo para seu Amuleto dos Elementos.
Você poderá jogar com 2, 3 ou 4 jogadores. Vocês estão numa cachoeira, em cima de pedras com montes de neve, fogo ou molhadas de água. Para eliminar os elementos das pedras e deixar as pedras limpas para poder pular, usamos o mesmo conceito do Desafio Ninja Normal: Fogo limpa neve, neve limpa água e água limpa fogo. Se você chegar muito perto da beira da cachoeira, irá cair e sairá do jogo. Quem conseguir chegar no gongo no fim do tabuleiro baterá nele e isso fará uma onda jogar todos cachoeira a baixo. Para piorar o jogo do seu adversário, você poderá jogar fogo/água/neve na pedra limpa na frente dele, fazendo-o perder tempo limpando a pedra. Você poderá ir para a diagonal, esquerda, direita ou frente. Você poderá seguir um jogador, pois ele limpará o caminho para você. Não é possível "sujar" a pedra atrás de você. Peixes em baixo do gongo ficarão soltando as pedras sujas e limpas, fazendo você ir para trás. O Quimono Água é composto pelas mesmas partes do de Fogo, e para conseguir a Pedra da Água você deve vencer o Sensei.
Você só pode jogar com 3 jogadores. Existem dois modos. No primeiro, você deve derrotar os capangas da neve, Scrap, Tank e Sly. Você deverá escolher um elemento entre Fogo, Água e Neve, para batalhar com as Shurikens da Neve, o Nunchaku do Fogo e o Martelo da Água. A batalha é em forma de tabuleiro, cada jogar pode se movimentar e atacar numa rodada(o Ninja da Neve também pode escolher recuperar um jogador). A batalha termina quando são vencidos 3 rodadas e, se as metas forem cumpridas, a rodada bônus, composta de 4 inimigos. Depois de conseguir o Quimono da Neve e a Pedra da Neve, 3 ninjas (e o Sensei) deve derrotar Tusk, o mestre da Neve. Depois de vencida a batalha(ou completa a porcentagem) você ganhará o último vídeo da Saga do Desafio Ninja e o Manto do Tusk. Mas ainda restam outras 12 recompensas após isso.
Este seria o quarto elemento da saga dos Desafios-Ninja e envolveria o elemento sombra. No Twitter, Spike Hike revelou que primeiro teria Neve. Infelizmente, os anos passaram e muitas teorias foram criadas ao longo do tempo, mas no dia 18 de julho de 2016, em um encontro, Megg confirmou que ele havia sido cancelado.
